<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Babol University of Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی بابل</title_fa>
<short_title>J Babol Univ Med Sci</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jbums.org</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1561-4107</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2251-7170</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.22088/jbums</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1398</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2019</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>21</volume>
<number>1</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>شناسایی سریع ایزوله های انتروکوکوس فکالیس با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی مراز(PCR)</title_fa>
	<title>Rapid Identification of Enterococcus Faecalis Isolates by Polymerase Chain Reaction</title>
	<subject_fa>میکروبیولوژی</subject_fa>
	<subject>Microbiology</subject>
	<content_type_fa>تحقیقی</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-family:times new roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:blue;&quot;&gt;سابقه&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:blue;&quot;&gt;و هدف: &lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;انتروکوکوس فکالیس به عنوان یک پاتوژن مهم در عفونت های بیمارستانی مطرح می باشد. شناسایی سریع انتروکوکوس فکالیس در عفونت های خطرناک به خصوص در افراد با نقص ایمنی مسئله مهمی به شمار می رود. هدف از انجام این مطالعه بررسی کارایی ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ef0737&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در شناسایی ایزوله های انتروکوکوس فکالیس و گونه های مشابه شامل انتروکوکوس فیسیوم و استافیلوکوکوس اورئوس می باشد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:blue;&quot;&gt;مواد و روش&amp;shy;ها:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; در این مطالعه مقطعی ۱۵۰ ایزوله بالینی شامل ۵۰ ایزوله انتروکوکوس فکالیس&#8204;&#8204;&#8204;، ۵۰ ایزوله انتروکوکوس فیسیوم و ۵۰ ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس از منابع مختلف عفونت جمع آوری شد. طراحی پرایمر با استفاده از توالی ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ef0737&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; انجام شد و همه ایزوله ها از نظر حضور ژن&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ef0737&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز (&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;) مورد بررسی قرار گرفتند. حساسیت &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; بر اساس ایزوله های بالینی انتروکوکوس فکالیس و اختصاصیت پرایمرها بر اساس ایزوله های غیر انتروکوکوس فکالیس شامل ۵۰ ایزوله انتروکوکوس فیسیوم و ۵۰ ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس بررسی شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:blue;&quot;&gt;یافته&amp;shy;ها:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; در این مطالعه از مجموع ۱۵۰ ایزوله بالینی ( ۵۰ ایزوله انتروکوکوس فکالیس، ۵۰ ایزوله انتروکوکوس فیسیوم و ۵۰ ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس ) همه ایزوله های انتروکوکوس فکالیس از نظر حضور ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ef0737&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; مثبت و حساسیت تست ۱۰۰% محاسبه شد. همچنین ایزوله های انتروکوکوس فیسیوم و استافیلوکوکوس اورئوس همگی از نظر حضور ژن &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ef0737&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; منفی شدند که نشانگر اختصاصیت پرایمرها بود.&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:blue;&quot;&gt;نتیجه گیری:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt; بر اساس نتایج این مطالعه یک روش حساس و کاربردی در شناسایی سریع انتروکوکوس فکالیس به خصوص در بیماران با شرایط بحرانی می باشد. شناسایی ژن حفاظت شده &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ef0737&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; در نمونه های بالینی احتمالا منجر به تشخیص سریع عفونت ناشی از انتروکوکوس فکالیس می شود.&lt;span style=&quot;font-family:2  mitra;&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:times new roman;&quot;&gt;&lt;strong&gt;BACKGROUND AND OBJECTIVE:&lt;/strong&gt; Rapid detection of&lt;em&gt; Enterococcus faecalis&lt;/em&gt; as a frequent cause of nosocomial infections in immunocompromised patients is an important issue. Herein, the current study developed a PCR assay based on the &lt;em&gt;ef0737&lt;/em&gt; gene to detect &lt;em&gt;E. faecalis&lt;/em&gt; isolates.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;METHODS:&lt;/strong&gt; In this cross-sectional study, 150 clinical isolates including &lt;em&gt;E&lt;/em&gt;&lt;em&gt;.&lt;/em&gt;&lt;em&gt; faecalis&lt;/em&gt;, &lt;em&gt;E. faecium&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;Staphylococcus aureus&lt;/em&gt; were collected. A set of pair primers was designed using the sequence of &lt;em&gt;ef0737. &lt;/em&gt;All isolates were examined for the presence of &lt;em&gt;ef0737&lt;/em&gt; gene by PCR assay. The sensitivity of PCR assay was evaluated according to 50 clinical isolates of &lt;em&gt;E. faecalis&lt;/em&gt;. The specificity of PCR primers was also determined using non&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;-&lt;/span&gt;&lt;em&gt;E. faecalis&lt;/em&gt; species including 50 &lt;em&gt;E. faecium&lt;/em&gt; and 50 &lt;em&gt;S. aureus &lt;/em&gt;isolates.&lt;span dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;FINDINGS:&lt;/strong&gt; In this study, from 150 clinical isolates that were collected; all the 50 &lt;em&gt;E. faecalis &lt;/em&gt;isolates showed positive results for the &lt;em&gt;ef0737&lt;/em&gt; gene which showed 100% sensitivity. No ampliﬁcation were observed in other isolates include &lt;em&gt;E. faecium&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;S. aureus&lt;/em&gt;.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;CONCLUSION:&lt;/strong&gt; PCR assay is a more efficient and sensitive tool for detection and characterization of &lt;em&gt;E. faecalis &lt;/em&gt;especially in patients with the critical condition&lt;em&gt;. &lt;/em&gt;Identification of the preserved &lt;em&gt;ef0737&lt;/em&gt; gene in clinical samples may be able to determine infections caused by &lt;em&gt;E. faecalis&lt;/em&gt;&lt;em&gt;.&lt;/em&gt;&lt;/span&gt;&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>انتروکوکوس فکالیس, ef0737, واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR).</keyword_fa>
	<keyword>Enterococcus faecalis, ef073, PCR</keyword>
	<start_page>105</start_page>
	<end_page>110</end_page>
	<web_url>http://jbums.org/browse.php?a_code=A-11-4184-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>S</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sabzi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سمیرا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سبزی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>samira6913@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460040168</code>
	<orcid>100319475328460040168</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>1.	Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, I.R.Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>۱-گروه پاتوبیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>S</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ohadian Moghaddam</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سولماز</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>اوحدیان مقدم</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>solmaz.ohadian@gmail.com</email>
	<code>100319475328460040169</code>
	<orcid>100319475328460040169</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>2.	Uro-Oncology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, I.R.Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>۲-مرکز تحقیقات سرطان های دستگاه ادراری و تناسلی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Z</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Pakbaz</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>زهرا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>پاکباز</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zahra.pak.1365@gmail.com</email>
	<code>100319475328460040170</code>
	<orcid>100319475328460040170</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>3.	Urology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, I.R.Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>۳- مرکز تحقیقات اورولوژی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>MR</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Pourmand</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>پورمند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>pourmand@gmail.com</email>
	<code>100319475328460040171</code>
	<orcid>100319475328460040171</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>4.	Biotechnology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, I.R.Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>۴- مرکز تحقیقات زیست فناوری، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
