en طراحی واکسن کایمریک علیه ویروس دنگی با استفاده از روش‌های ایمونوانفورماتیک و داکینگ پاتولوژی Pathology تحلیلی Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:16.0pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span lang="AR-SA">سابقه<b> </b>و هدف: </span></b><span lang="FA">طی پنج سال گذشته، انتقال ویروس دنگی به انسان توسط پشه‌های آئدس آلوده به طور قابل توجهی افزایش یافته است. روش‌های پیشگیرانه مانند ساخت واکسن موثر بهترین گزینه برای مبارزه با عفونت دنگی است. هدف از این مطالعه توسعه واکسن‌ کایمریک علیه ویروس‌ دنگی با استفاده از روش‌های ایمونو انفورماتیک و داکینگ مولکولی می‌باشد</span><span lang="AR-SA">.</span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:16.0pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span lang="AR-SA">مواد و روش‌ها: </span></b><span lang="FA">در این آنالیز </span><span dir="LTR">in silico</span><span lang="FA">، پروتئین ژنومی ویروس دنگی برای ساخت واکسن نوترکیب استفاده شد. 5 اپی توپ لنفوسیت سلول (</span><span dir="LTR">BCL</span><span lang="FA">) </span><span dir="LTR">B</span><span lang="FA">، </span><span dir="LTR">5</span><span lang="FA"> اپی توپ لنفوسیت </span><span dir="LTR">T</span><span lang="FA"> سیتوتوکسیک (</span><span dir="LTR">CTL</span><span lang="FA">) و 5 اپی توپ لنفوسیت </span><span dir="LTR">T</span><span lang="FA"> کمکی (</span><span dir="LTR">HTL</span><span lang="FA">)، ادجوانت مناسب و پیوند دهنده‌ها در ساختار واکسن نهایی چند اپی توپی انتخاب شدند. سازه برای پیش بینی خواص آنتی ژنی، آلرژی زایی، و فیزیکوشیمیایی و همچنین ساختارهای دو و سه بعدی به صورت محاسباتی مورد تجزیه و آنالیز قرار گرفت. در نهایت، مطالعات تحلیلی دیگر با داکینگ مولکولی و کلونینگ </span><span dir="LTR">in silico</span><span lang="FA"> انجام شد</span><span lang="AR-SA">. </span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:16.0pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span lang="AR-SA">یافته‌ها: </span></b><span lang="FA">بر اساس یافته‌های ما، واکسن طراحی شده با 320 باقیمانده دارای خواص آنتی ژنی و فیزیکوشیمیایی مناسبی است. مطالعات اتصال مولکولی بین واکسن توسعه ‌یافته و پنج </span><span dir="LTR">TLR</span> <span lang="FA">نشان داد که واکسن بهترین میل و انصال را با </span><span dir="LTR">TLR3</span><span lang="FA"> و </span><span dir="LTR">TLR9</span><span lang="FA"> دارد. بهینه سازی کدون نشان می دهد که </span><span dir="LTR">E. coli str. K12</span> <span lang="FA">میزبان مناسبی برای توالی </span><span dir="LTR">DNA</span><span lang="FA"> خطی بهینه یافته می‌باشد</span><span lang="AR-SA">.</span><b><span lang="FA" style="font-family:"B Mitra""></span></b></span></span></span></span><br> <b><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">نتیجه‌گیری: </span></span></b><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">بر اساس نتایج این مطالعه واکسن نهایی طراحی شده که بر اساس 15 اپی توپ (5 اپی توپ سلول </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">B</span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">، </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">5</span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%"> اپی توپ </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">CTL</span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%"> و 5 اپی توپ </span></span><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">HTL</span></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%">) و ادجوانت می‌باشد، به طور بالقوه دارای خاصیت آنتی ژنی می‌باشد و غیر حساسیت زاست.</span></span> </span></div> <span style="font-size:11pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="line-height:107%"><span sans-serif="" style="font-family:Calibri,"><span dir="LTR" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span style="font-family:"Times New Roman","serif""></span></span></span></span></span></span></span></span> <div style="text-align: justify;"><span style="font-family:Times New Roman;"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:14.0pt"><b><span style="font-size:10.0pt">Background and Objective:</span></b><span style="font-size:10.0pt"> Over the past five years, transmission of the dengue virus to humans by infected Aedes mosquitoes has increased significantly. Preventive methods such as developing an effective vaccine are the best option to combat dengue infection. The aim of this study is to develop chimeric vaccines against dengue viruses using immunoinformatics and molecular docking approaches.</span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:14.0pt"><b><span style="font-size:10.0pt">Methods:</span></b><span style="font-size:10.0pt"> In this in silico analysis<b>, </b>the genomic protein of dengue viruses was used to develop a recombinant multivalent epitope vaccine. 5 B cell lymphocyte (BCL) epitopes, 5 cytotoxic T lymphocyte (CTL) epitopes, and 5 helper T lymphocyte (HTL) epitopes, suitable adjuvant, and linkers were chosen in the structure of the final multi-epitope vaccine. The construct was analyzed computationally to predict antigenic, allergenic, and physiochemical properties as well as two- and three-dimensional structures. Finally, another analytical study was carried out by docking and in silico cloning</span><span lang="EN" style="font-size:10.0pt">.</span><span style="font-size:10.0pt"><span style="font-family:"Times New Roman","serif""></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:14.0pt"><b><span style="font-size:10.0pt">Findings:</span></b><span style="font-size:10.0pt"> Based on our findings, the designed vaccine with 320 residues has suitable antigenicity and physicochemical properties. Molecular docking simulations between the engineered vaccine construct and five Toll-like receptors (TLRs) revealed that the vaccine displays the strongest binding affinity and optimal docking conformation with TLR3 and TLR9. Furthermore, codon optimization analysis identified Escherichia coli strain K12 as a suitable host for improved linear DNA sequences.</span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:14.0pt"><b><span style="font-size:10.0pt">Conclusion:</span></b><span style="font-size:10.0pt"> Based on the results of this study, the final vaccine construct comprises 15 epitopes (5 B-cell epitopes, 5 CTL epitopes, and 5 HTL epitopes) along with an adjuvant. It is potentially antigenic and non-allergenic. </span></span></span></span><br> &nbsp;</div> واکسن, دنگی, محاسبات کامپیوتری, ایمونو انفورماتیک, تب, داکینگ. Vaccines, Dengue, Computer Simulation, Immunoinformatics, Fever, Docking. 0 0 http://jbums.org/browse.php?a_code=A-10-8411-1&slc_lang=en&sid=1 A Asadzadeh عزیزه اسدزاده az.asadzadeh@nourdanesh.ac.ir 100319475328460070672 100319475328460070672 Yes 1.Department of Biology, Faculty of Science, Nour Danesh Institute of Higher Education, Isfahan, I.R.Iran. 1. گروه زیست شناسی، دانشکده‌ علوم پایه، مؤسسه‌ آموزش عالی نور دانش، اصفهان، ایران K Dastan کتایون داستان k_dastan2009@yahoo.co.uk 100319475328460070673 100319475328460070673 No 2.Department of Microbiology, Faculty of Basic Sciences, Lahijan Branch, Islamic Azad University, Lahijan, I.R.Iran. 2. گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد لاهیجان، دانشگاه آزاد اسلامی، لاهیجان، ایران N Ghorbani نفیسه قربانی ghorbaninafiseh@yahoo.com 100319475328460070674 100319475328460070674 No 2.Department of Microbiology, Faculty of Basic Sciences, Lahijan Branch, Islamic Azad University, Lahijan, I.R.Iran. 2. گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد لاهیجان، دانشگاه آزاد اسلامی، لاهیجان، ایران